MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 122503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	AGTT	2	8	345	352	25 %	50 %	25 %	0 %	150014893
2	NC_009617	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014893
3	NC_009617	TA	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	150014893
4	NC_009617	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014893
5	NC_009617	AGA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
6	NC_009617	TCA	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
7	NC_009617	ATG	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
8	NC_009617	GTC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
9	NC_009617	GTAATA	2	12	650	661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014893
10	NC_009617	TGC	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
11	NC_009617	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	150014893
12	NC_009617	ATGC	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	150014893
13	NC_009617	TAA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
14	NC_009617	GAT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
15	NC_009617	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
16	NC_009617	AAAT	2	8	888	895	75 %	25 %	0 %	0 %	150014893
17	NC_009617	CTTA	2	8	912	919	25 %	50 %	0 %	25 %	150014893
18	NC_009617	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
19	NC_009617	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
20	NC_009617	ATG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
21	NC_009617	ATTAT	2	10	1009	1018	40 %	60 %	0 %	0 %	150014893
22	NC_009617	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
23	NC_009617	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	150014893
24	NC_009617	CTA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
25	NC_009617	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
26	NC_009617	AAT	2	6	1245	1250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
27	NC_009617	CTC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150014893
28	NC_009617	TAAC	2	8	1265	1272	50 %	25 %	0 %	25 %	150014893
29	NC_009617	ATA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
30	NC_009617	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
31	NC_009617	GGA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014893
32	NC_009617	TGA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
33	NC_009617	A	7	7	1608	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	150014893
34	NC_009617	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	150014894
35	NC_009617	CAA	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
36	NC_009617	TA	3	6	1990	1995	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
37	NC_009617	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
38	NC_009617	TAT	2	6	2070	2075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
39	NC_009617	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
40	NC_009617	ATA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
41	NC_009617	TAA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
42	NC_009617	AT	3	6	2285	2290	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
43	NC_009617	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	150014894
44	NC_009617	CTT	2	6	2312	2317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
45	NC_009617	TTC	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
46	NC_009617	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
47	NC_009617	AGA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
48	NC_009617	TAA	2	6	2541	2546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
49	NC_009617	AT	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
50	NC_009617	ATTTA	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	150014894
51	NC_009617	ATA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
52	NC_009617	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
53	NC_009617	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
54	NC_009617	TAA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
55	NC_009617	GGA	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
56	NC_009617	GTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014894
57	NC_009617	GAA	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
58	NC_009617	ATA	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
59	NC_009617	AGG	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
60	NC_009617	AATAA	2	10	3031	3040	80 %	20 %	0 %	0 %	150014895
61	NC_009617	T	6	6	3072	3077	0 %	100 %	0 %	0 %	150014895
62	NC_009617	A	6	6	3175	3180	100 %	0 %	0 %	0 %	150014895
63	NC_009617	GTA	2	6	3196	3201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014895
64	NC_009617	ATA	2	6	3226	3231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014895
65	NC_009617	TATG	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	150014896
66	NC_009617	A	6	6	3325	3330	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
67	NC_009617	TAT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
68	NC_009617	CA	3	6	3434	3439	50 %	0 %	0 %	50 %	150014896
69	NC_009617	TAA	2	6	3461	3466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
70	NC_009617	TAGAT	2	10	3513	3522	40 %	40 %	20 %	0 %	150014896
71	NC_009617	A	7	7	3523	3529	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
72	NC_009617	GTA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
73	NC_009617	AGA	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
74	NC_009617	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
75	NC_009617	AAG	3	9	3675	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
76	NC_009617	ATA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
77	NC_009617	GAAA	2	8	3760	3767	75 %	0 %	25 %	0 %	150014896
78	NC_009617	TTA	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
79	NC_009617	ATTAT	2	10	3842	3851	40 %	60 %	0 %	0 %	150014896
80	NC_009617	AT	3	6	3867	3872	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
81	NC_009617	AGA	2	6	3927	3932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
82	NC_009617	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
83	NC_009617	A	7	7	3996	4002	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
84	NC_009617	ATA	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
85	NC_009617	GAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
86	NC_009617	ATA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
87	NC_009617	ACA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014896
88	NC_009617	AG	3	6	4171	4176	50 %	0 %	50 %	0 %	150014896
89	NC_009617	TAT	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
90	NC_009617	GAT	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
91	NC_009617	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
92	NC_009617	TA	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
93	NC_009617	TAA	2	6	4280	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
94	NC_009617	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
95	NC_009617	GAT	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
96	NC_009617	AT	3	6	4379	4384	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
97	NC_009617	GTA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014897
98	NC_009617	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014897
99	NC_009617	ACAAT	2	10	4476	4485	60 %	20 %	0 %	20 %	150014897
100	NC_009617	AGA	3	9	4499	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
101	NC_009617	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	150014897
102	NC_009617	AGA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
103	NC_009617	ATA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014897
104	NC_009617	AT	3	6	4581	4586	50 %	50 %	0 %	0 %	150014897
105	NC_009617	ATC	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014897
106	NC_009617	ATG	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
107	NC_009617	TCA	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014898
108	NC_009617	ATA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
109	NC_009617	TGA	2	6	4850	4855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
110	NC_009617	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
111	NC_009617	GGT	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150014898
112	NC_009617	GGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014898
113	NC_009617	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
114	NC_009617	AT	3	6	5122	5127	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
115	NC_009617	GCA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150014898
116	NC_009617	AAAGG	2	10	5145	5154	60 %	0 %	40 %	0 %	150014898
117	NC_009617	TGA	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
118	NC_009617	TAAA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	150014898
119	NC_009617	AT	4	8	5304	5311	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
120	NC_009617	TAG	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
121	NC_009617	AGA	2	6	5339	5344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
122	NC_009617	TA	4	8	5423	5430	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
123	NC_009617	ATA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
124	NC_009617	AT	3	6	5497	5502	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
125	NC_009617	CAA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014898
126	NC_009617	ACTA	2	8	5567	5574	50 %	25 %	0 %	25 %	150014898
127	NC_009617	A	7	7	5594	5600	100 %	0 %	0 %	0 %	150014898
128	NC_009617	TGA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
129	NC_009617	CAAA	2	8	5706	5713	75 %	0 %	0 %	25 %	150014898
130	NC_009617	TTG	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
131	NC_009617	TTG	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
132	NC_009617	GCCAGA	2	12	5838	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150014898
133	NC_009617	TA	3	6	5961	5966	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
134	NC_009617	GAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
135	NC_009617	TAGA	2	8	6073	6080	50 %	25 %	25 %	0 %	150014898
136	NC_009617	ATA	2	6	6166	6171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
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